Kopi berasal dari bawah naungan hutan tropis. Tanpa naungan, tanaman berbuah terlalu lebat pada satu musim lalu merosot pada musim berikutnya.
Penaung dari keluarga polong-polongan seperti lamtoro, dadap, dan gamal juga menambah nitrogen ke tanah melalui bintil akar dan guguran daunnya.